Johannes Schlaefli ist derzeit künstlerischer Leiter des Schweizer Jugendsinfonieorchesters SJSO und des Alumni Sinfonieorchesters Zürich. Er ist ständiger Gastprofessor bei den Dirigierklassen an den Musikhochschulen in Zürich und Frankfurt. Als einer der weltweit gefragtesten Dirigierlehrer wurde er von Institutionen wie der Sibelius-Akademie Helsinki, der Juilliard-School New York, dem City of Birmingham Symphony Orchestra, dem Aspen Music Festival und vielen anderen eingeladen. Er ist ausserdem Head of Teaching an der Gstaad Menuhin Festival Conducting Academy und arbeitet mit dem renommierten Dirigentenforum in Deutschland sowie mit dem norwegischen DirigentlØftet in Oslo zusammen. Als Gastprofessor unterrichtete er an den Musikhochschulen in Wien, Berlin, Leipzig,
Hamburg, Manchester, Kopenhagen und Helsinki.
 
Johannes Schlaefli war Mitbegründer des Kammerorchesters Basel im Jahr 1984. Von 1995 bis 2013 war er Chefdirigent des Berner Kammerorchesters, bevor er von 2013 bis 2019 als Chefdirigent das Mannheimer Kammerorchester leitete. Seit 2018 ist er Chef-dirigent des Sinfonieorchesters Collegium Musicum Basel und wird seine Amtszeit im Sommer 2024 beenden. Als Gastdirigent konzertierte er in seinem Heimatland mit Orchestern wie dem Tonhalle-Orchester Zürich, dem Orchestra della Svizzera Italiana Lugano, den Sinfonieorchestern in Biel, Bern, St. Gallen, Luzern, der Kammerphilharmonie Chur, dem Zürcher Kammerorchester und dem argovia philharmonic. International gastierte er u.a. bei der Hong Kong Sinfonietta, dem Indianapolis Chamber Orchestra, dem Knoxville Symphony Orchestra, dem Münchner Rundfunkorchester, der Janáček Philharmonie Ostrava, der Philharmonia Prag, dem Allegra Festival Orchester Sofia, der Südwestdeutschen Philharmonie Konstanz, dem Sinfonieorchester Göttingen und der Berlin Sinfonietta.


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